物理与电子工程系下设教学科研科、综合办公室、学生科、教研室、物理实验教学中心。教学科研科负责协助系主任完成我系日常教学管理、科研管理工作；综合办公室协助我系党政领导做好学院日常行政工作，以及与学校有关职能部门、教学学院的沟通与协调；学生科负责学生思想教育与日常管理工作。教研室负责教学计划、教学大纲的制定和执行；积极开展教研活动促进教学水平提高；师资队伍的建设与管理；教书育人，做好学生德育和能力培养工作。物理实验教学中心负责物理学专业、电子科学与技术专业学生的实验、实习实训。

物理与电子工程系现任领导